女神崛起

第一幕：误入异界

被纳入《女神异闻录1》的主角，高中生花村怜，一次偶然的机会被传送到了另一个世界，他发现自己身处于一个广为流传的神话世界中。这个世界是由许多的房间组成，每个房间都有自己的规则和怪物，房间里的人类为了生存，守卫着自己的据点，埋首苦干。很快，怜便加入了这个世界的玩家们，探究着新的房间，完成任务，提升实力。

第二幕：女神显灵

一天，怜所在的团队接到了一项任务——拯救因某种原因被困在陷阱中的女神。她是东方神话里的神明妙音，也因此被称为“妙音女神”。团队经过一系列的考验，终于解救出了妙音女神。女神感到非常感动，决定将自己的祝福赠予团队中的每一个人。祝福的效果让团队成员的能力得到了极大的提升，妙音女神也从此成为了怜和他的伙伴们的守护神。

第三幕：神殿之战

一股神秘的力量开始困扰着这个世界，这个力量蕴藏着来自不为人知的力量，妙音女神感到非常不安。于是她告诉了团队她的“使命”，她和其他的女神一样，要守护这个世界，保护这个世界不受外界干扰。之后，被称为“塔”的地方出现在这个世界上，这是一个充满着危险和奇妙的地方，而妙音女神的“圣殿”就在这个塔的最顶端。团队开始攀登这座塔，经过了无数的战斗和考验，最终来到了塔的最高层，也是妙音女神的圣殿所在之处。他们与女神一起承受了一股强大的力量，将它击退，保护了这个世界的平衡和安宁。